mitsuha, une jeune fille élevée dans une famille traditionnelle, s'ennuie dans ses montagnes natales et voudrait connaître la vie excitante d'une grande ville. à tokyo, taki est débordé, entre le lycée, son travail à temps partiel et ses amis.
un jour, mitsuha rêve qu’elle est un jeune homme à tokyo, tandis que taki se voit en rêve dans la peau d’une adolescente du japon rural… contre toute attente, leurs rêves respectifs sont devenus réalité  : leurs corps se sont échangés et chacun vit la vie de l’autre  !
attirés de façon inexplicable, mitsuha & taki vont tout faire pour se retrouver bien que le temps et l’espace semblent les séparer…