wizard city, la ville où tout le monde peut venir, mais où personne n'est le bienvenu. l'endroit le plus mal famé de la ville : le club neverland. ceux qui tiennent à la vie savent qu'il vaut mieux rester à l'écart de ce repaire de criminels.

c'est là que la fée fran, captuée par un gang, fait la rencontre de koyukimaru, un jeune ninja lui aussi retenu prisonnier. ils parviennent à s'enfuir avec à leurs trousses les pires criminels de la ville qui cherchent à mettre la main sur le rouleau du cataclysme dont seul koyukimaru connaît l'emplacement. commence alors pour eux un long combat contres les ténèbres qui menacent d'engloutir wizard city.